2008年12月，國務(wù)院正式批準(zhǔn)設(shè)立廣西憑祥綜合保稅區(qū)。這是我國繼蘇州工業(yè)園綜合保稅區(qū)、天津濱海新區(qū)綜合保稅區(qū)、北京天竺綜合保稅區(qū)和?？诰C合保稅區(qū)之后的第五個綜合保稅區(qū)。憑祥綜合保稅區(qū)是廣西繼欽州保稅港區(qū)之后，再獲國家批準(zhǔn)設(shè)立的開放層次最高、優(yōu)惠政策最多、功能最齊全、手續(xù)最便捷的特殊經(jīng)濟開放區(qū)域。憑祥綜合保稅區(qū)規(guī)劃控制面積8.5平方公里。
憑祥綜合保稅區(qū)功能：　憑祥綜合保稅區(qū)具有對外開放口岸、保稅物流、保稅出口加工、國際貿(mào)易、國際中轉(zhuǎn)、國際配送，國內(nèi)外采購、分銷和配送等功能。
憑祥綜合保稅區(qū)除了享有保稅區(qū)應(yīng)有的優(yōu)惠政 策外，還同時享有自治區(qū)《關(guān)于促進廣西北部灣經(jīng)濟區(qū)開放開發(fā)的若干政策規(guī)定》中的優(yōu)惠政策，是目前我國享受優(yōu)惠條件最多的保稅區(qū)之一。憑祥綜合保稅區(qū)實行封閉管理。海關(guān)總署將會同有關(guān)部門，切實做好憑祥綜合保稅區(qū)的監(jiān)管、服務(wù)工作，促進其健康有序發(fā)展。
憑祥綜合保稅區(qū)作為中越跨境經(jīng)濟合作區(qū)的中方母體與越方對接。憑祥綜合保稅區(qū)除了擁有各大綜合保稅區(qū)的優(yōu)惠政策外，還有民族自治區(qū)、西部大開發(fā)、邊貿(mào)開發(fā)、大湄公河次區(qū)域合作等優(yōu)惠政策，綜合政策優(yōu)惠居所有綜保區(qū)之首。